你知道核酸凝胶染料有哪些特点么?下面就让我们一起来了解一下吧。
1、无毒性:*的油性和大分子量特点使其不能穿透细胞膜进入细胞内,艾姆斯氏试验结果也表明,该染料的诱变性远远小于EB。
2、灵敏度高:适用于各种大小片段的电泳染色,对核酸迁移的影响小于SYBRGreenI。
3、稳定性高:适用于使用微波或其它加热方法制备琼脂糖凝胶;室温下在酸或碱缓冲液中极其稳定,耐光性强。
4、信噪比高:样品荧光信号强,背景信号低。
5、操作简单:与EB一样,在预制胶和电泳过程中染料不降解;而电泳后染色过程也只需30分钟且无需脱色或冲洗,即可直接用紫外凝胶透射仪观察。
6、与EB有相同的光谱特性,无需改变滤光片及观察装置:标准的EB滤光片或SYBR滤光片都适用,使用与观察EB相同的普通紫外凝胶透射仪观察即可,在300nm紫外光附近可得到*激发。
但是不能被488nm氩离子激光器或相似波长的可见光*激发,因此不推荐使用此类激发装置的成像系统。对于此类装置,我们推荐您使用DuGreen(Cat#011或012),它和SYBRGreenI的光谱相似,灵敏度相当,但更加稳定。
核酸凝胶染料注意事项:
1、此方法染色染料用量相对较少。500μL染料大约可以做100块50mL的胶。
2、由于具有良好的热稳定性,可以在热的琼脂糖溶液中直接添加,而不需要等待溶液冷却。摇晃,振荡或者翻转以保证染料充分混匀。
也可以选择将储液加到琼脂糖粉末和电泳缓冲液中,然后用微波炉或其他常用方式加热以制备琼脂糖凝胶。兼容所有常用的电泳缓冲溶液。
3、如果总是看到条带弥散或分离不理想,建议使用泡染法染色以确认问题是否与染料有关。如果染色后问题依旧存在,则说明问题与染料无关,请尝试:降低琼脂糖浓度;选用更长的凝胶;延长凝胶时间以保证边缘清晰;改进上样技巧或选择泡染法染色。
4、此方法不适合预制聚丙烯酰胺凝胶,对于聚丙烯酰胺凝胶请使用泡染法。